Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn18P56857 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms