Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sh3bp1P55194 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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