Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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