Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpreP49446 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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