Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrprbP47758 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SrprbP47758 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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SrprbP47758 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SrprbP47758 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SrprbP47758 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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