Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PpardP35396 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PpardP35396 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PpardP35396 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PpardP35396 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PpardP35396 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PpardP35396 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PpardP35396 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PpardP35396 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PpardP35396 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PpardP35396 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PpardP35396 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpardP35396 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpardP35396 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms