Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Saa4P31532 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms