Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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