Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms