Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VtnP29788 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135 ms