Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pabpc1P29341 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms