Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms