Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nfkb1P25799 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms