Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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