Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms