Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csn1s1P19228 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms