Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms