Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RhoP15409 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhoP15409 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhoP15409 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhoP15409 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RhoP15409 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RhoP15409 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhoP15409 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhoP15409 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhoP15409 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhoP15409 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhoP15409 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RhoP15409 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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