Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmnb1P14733 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms