Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RaraP11416 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RaraP11416 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RaraP11416 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RaraP11416 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RaraP11416 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RaraP11416 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RaraP11416 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RaraP11416 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RaraP11416 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms