Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms