Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P10404 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P10404 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P10404 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P10404 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P10404 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P10404 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
P10404 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P10404 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P10404 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P10404 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P10404 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms