Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UbbP0CG49 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms