Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms