Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfrbP05622 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PdgfrbP05622 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PdgfrbP05622 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms