Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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