Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccl20O89093 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ccl20O89093 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ccl20O89093 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ccl20O89093 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ccl20O89093 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ccl20O89093 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ccl20O89093 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ccl20O89093 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Ccl20O89093 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms