Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Cops6O88545 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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