Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp4O70480 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms