Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Copb2O55029 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Copb2O55029 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Copb2O55029 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Copb2O55029 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Copb2O55029 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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