Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChkaO54804 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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