Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DffaO54786 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DffaO54786 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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DffaO54786 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffaO54786 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffaO54786 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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