Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms