Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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