Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Dgcr6O35347 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Dgcr6O35347 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dgcr6O35347 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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