Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casq1O09165 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casq1O09165 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casq1O09165 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casq1O09165 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casq1O09165 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casq1O09165 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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Casq1O09165 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casq1O09165 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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Casq1O09165 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Casq1O09165 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casq1O09165 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Casq1O09165 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casq1O09165 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casq1O09165 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casq1O09165 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Casq1O09165 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casq1O09165 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casq1O09165 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casq1O09165 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Casq1O09165 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casq1O09165 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Casq1O09165 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Casq1O09165 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Casq1O09165 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casq1O09165 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Casq1O09165 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casq1O09165 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Casq1O09165 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casq1O09165 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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Casq1O09165 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casq1O09165 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Casq1O09165 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casq1O09165 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Casq1O09165 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casq1O09165 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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