Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm20939L7N243 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms