Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm2056J3QQ02 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms