Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms