Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Smim18J3QNP2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Smim18J3QNP2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim18J3QNP2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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