Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top6blJ3QMY9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms