Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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