Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AK157302I3ITR1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms