Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

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Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20708H3BKF4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20708H3BKF4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20708H3BKF4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20708H3BKF4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20708H3BKF4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20708H3BKF4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20708H3BKF4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20708H3BKF4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20708H3BKF4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20708H3BKF4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20708H3BKF4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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