Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3tc1G3X9F6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3tc1G3X9F6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms