Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp32F8VPZ3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp32F8VPZ3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms