Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer4aF8VPX6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms