Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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