Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85cE9Q6B2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms