Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms